TY  - MANSCPT
AU  - الشريف، رعد بن فهيد ناصر
AU  - العيفان، صالح بن أحمد
AU  - رفعت، أحمد محمد
TI  - تأثير البكتريا السائدة في مدينة الرياض على جودة الحمض النووي في الدم وتحديد السمات الوراثية
U1  - 547.7909531 21
PY  - 2013///
KW  - الأحياء الجنائية
KW  - السعودية
KW  - الأحماض النووية
KW  - الدم
KW  - تحليل
KW  - فزيولوجيا
KW  - تحليل الدم
KW  - الحمض النووي
KW  - السمات الوراثية
KW  - البكتريا
KW  - الأدلة الجنائية
KW  - تحضير العينات
KW  - رسالة جامعية (ماجستير)
N1  - يشتمل على ملاحق; إشراف : صالح بن أحمد العيفان، أحمد محمد رفعت.; أطروحة (ماجستير)-جامعة نايف العربية للعلوم الأمنية، كلية علوم الأدلة الجنائية، قسم الأحياء الجنائية، 2013; ببليوجرافية : ص. 88-92; غير مسموح بالاستعارة الخارجية
N2  - موضوع الدراسة : تأثير البكتريا السائدة في مدينة الرياض على جودة الحمض النووي في الدم وتحديد السمات الوراثية .
أهداف الدراسة : 
1-	التوصل إلى معرفة تأثير التلوث البكتيري الموجود في مدينة الرياض على جودة واستخلاص وكيفية الحمض النووي DNA وقراءه السمات الوراثية للعينات الملوثة.
2-	التعرف على أنواع البكتريا التي تنمو على بيئات الدم المختلفة.
3-	الإرتقاء بجودة العمل وزيادة المهارات المعملية في كيفية العمل مع الحمض النووي المتحلل بواسطة البكتريا.

منهج الدراسة وادواتها : إستخدام التقنيات المعملية المتاحة في دراسة الحمض النووي DNA وتأثير البكتريا المختلفة علية.
أهم النتائج :
1-	 تم عزل بكتريا Chryseobacterium indologenes, Burkholderia cepacia, Chryseobacterium spp من بيئة الرياض وهي جميعاً بكتريا سالبة لصبغة جرام   .
2-	اكتمال السمات الوراثية في مواقع STR في كل بقع الدماء المعرضة للتلوث داخل الغرفة لأوقات مختلفة وفي المقابل كانت نتيجة السمات الوراثية لبقع الدماء المعرضة لأشعة الشمس جزئية . 
3-عدم ظهور السمات الوراثية لعينات الدماء التي تم تلقيحها بالبكتريا على آجار الدم عند درجة حراره 37 درجة مئوية.
التوصيات: 
1-	الاستخلاص والتقدير الكمي والنوعي وتكثير الحمض النووي المتحلل بفعل البكتريا أو عوامل البيئة المختلفة ينبغي ان تنفذ بعناية كبيره لأن الجينيوم كاملا قد يكون اقل من 20 pico gram/µl.
2-	من أجل الحصول على سمات وراثية من عينات دم متحلله , تكثير الحمض النووي باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل PCR يبنغي ان يكون من 28 -30 دورة علاوه على ذلك تنقية نواتج التكثير قبل عملية االهجرة الكهربية قد تعطي نتائج ذات جودة عالية.
3-	توصي الدراسة بمزيد من العمل البحثي مع زيادة حجم العينة لتحقيق نتائج ذات دلاله إحصائية قاطعة; Subject of Research: Effect of Riyadh environmental bacterial flora on the quality and autosomal short tandem repeat (STR) genotyping of HGDNA in the blood 
Research Methodology and Tools: All the available molecular biology techniques and methodologies were applied for the extraction, quantitation and autosomal STR profiling of HGDNA recovered from blood stains inoculated with Saudi environmental bacterial flora. 
Study Objectives: 
1.	Isolation and identification of bacterial flora prevalent in the Riyadh (Saudi Arabia) region environment, and study in vitro and quantify the effect of bacterial growth, at different locations and for different time intervals, on the quality of HGDNA and autosomal STR genotyping.
2.	Upgrade the current state of knowledge and skills regarding the autosomal STR analysis of HGDNA degraded either by bacteria or environmental insults. 
Main Results: 
1.	Chryseobacterium indologenes, Burkholderia cepacia and Chryseobacterium spp., all gram negative bacteria, were isolated from Riyadh environment.
2.	Complete autosomal STR profile, comprising of 15 autosomal loci and one gender marker, was obtained from the inoculated blood stains incubated for different time intervals at room temperature or outside shaded environment. On the other hand, partial autosomal STR profile was obtained from the inoculated blood stains exposed to direct sunlight for different time intervals.
3.	No DNA profile could be obtained from the inoculated blood stains incubated on blood agar plates at 37ºC under humid conditions. 
Recommendations:

1.	Extraction, quantitation and amplification of  blood stains, suspected to be degraded by bacterial growth, sunlight and/or moisture, should be carried out very carefully as the yield of HGDNA might be less than 20 pico gram/µl.
2.	In order to obtain type-able amount of DNA from degraded blood stains, PCR amplification should be increased from 28 to 30 cycles. Moreover, pre-electrophoresis purification of amplified products may enhance the quality of genotyping results. 
3.	Further research work with large sample size is required to achieve statistically significant and conclusive results
UR  - http://repository.nauss.edu.sa/handle/123456789/58460
ER  -